O Alto Tietê enfrentou o fechamento de diversos locais de votação mesmo após a prorrogação do horário, determinada pelo ministro Cristiano Zanin, do Supremo Tribunal Federal (STF). A extensão, que valeu até às 19h, foi anunciada para todo o país, mas muitos locais já haviam encerrado as atividades antes da decisão.
Segundo o presidente do Tribunal Regional Eleitoral de São Paulo (TRE-SP), mais de 80% das urnas do estado já tinham finalizado a votação quando a prorrogação foi recebida. Entre as escolas que permaneceram fechadas estão a Homero Fernando Milano Kakunosuke Hasegawa e a Antônio Rodrigues de Almeida, em Itaquaquecetuba, além da Sebastião Gregório dos Santos e a Raul Brasil, em Suzano.
Por volta das 17h, cartórios de Arujá, Itaquaquecetuba, Mogi das Cruzes e Poá relataram que várias seções eleitorais já haviam encerrado suas atividades. Em Arujá, 11 colégios eleitorais estavam fechados, e a Escola Estadual Homero Fernando Milano não teve prorrogação nas seções.
A decisão do STF foi motivada por relatos de dificuldades no transporte público enfrentadas por eleitores em várias regiões do Brasil. A medida também resultou na suspensão da totalização dos votos, que havia começado antes da prorrogação. A solicitação para ampliar o horário de votação foi feita pela coligação do candidato Luiz Inácio Lula da Silva (PT).
Apesar da gratuidade dos ônibus e do reforço na circulação anunciado pela prefeitura de Mogi das Cruzes, eleitores relataram dificuldades para chegar aos locais de votação, com esperas de até uma hora pelo transporte coletivo. O g1 tentou contato com o TRE-SP e o TSE para saber se alguma escola acatou a prorrogação, mas não obteve resposta até o fechamento desta matéria.